MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 6840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010278	AAAT	2	8	275029	275036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010278	CAA	2	6	275090	275095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010278	CGTT	2	8	275134	275141	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_010278	AGC	2	6	275171	275176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010278	AAC	2	6	275234	275239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010278	CTT	2	6	275248	275253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_010278	TAC	2	6	275318	275323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010278	GTG	2	6	275324	275329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010278	TAA	2	6	275335	275340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_010278	GGTTG	2	10	275367	275376	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_010278	GAG	2	6	275426	275431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010278	CTT	2	6	275477	275482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_010278	TGT	2	6	275499	275504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010278	TTGAT	2	10	275505	275514	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_010278	T	6	6	275567	275572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010278	GAC	2	6	275655	275660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_010278	GAAGA	2	10	275703	275712	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010278	GAT	2	6	275762	275767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010278	AAGC	2	8	275838	275845	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_010278	GAA	2	6	275898	275903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_010278	GCC	2	6	275962	275967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_010278	CTTTTA	2	12	276038	276049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1023	NC_010278	TTAA	2	8	276112	276119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010278	CTT	2	6	276200	276205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_010278	CAA	2	6	276292	276297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_010278	TGC	2	6	276324	276329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010278	GGA	2	6	276468	276473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010278	TAA	2	6	276495	276500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010278	CAT	2	6	276555	276560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_010278	TCG	2	6	276593	276598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_010278	CTA	2	6	276674	276679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_010278	TAA	2	6	276684	276689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010278	TTA	2	6	276706	276711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_010278	TGA	2	6	276731	276736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_010278	CTT	2	6	276758	276763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_010278	CAA	2	6	276812	276817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_010278	GGT	2	6	276818	276823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010278	AAT	2	6	276885	276890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010278	CCG	2	6	276893	276898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_010278	TGA	2	6	276966	276971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010278	A	7	7	277004	277010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010278	GTTT	2	8	277031	277038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010278	AC	3	6	277056	277061	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_010278	GGT	2	6	277102	277107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_010278	TTG	2	6	277149	277154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010278	GA	3	6	277175	277180	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010278	GTTTG	2	10	277193	277202	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_010278	T	8	8	277210	277217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010278	T	7	7	277271	277277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010278	A	6	6	277288	277293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010278	TCT	2	6	277299	277304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_010278	AATA	2	8	278036	278043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010278	T	7	7	279223	279229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010278	GAT	2	6	279230	279235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_010278	AAT	2	6	279288	279293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_010278	TAA	2	6	281272	281277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010278	A	6	6	281276	281281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010278	T	7	7	281327	281333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010278	CA	3	6	281379	281384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1060	NC_010278	ACG	2	6	281385	281390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010278	TGT	2	6	281394	281399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010278	CGT	2	6	281421	281426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_010278	T	6	6	281429	281434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010278	AAC	2	6	281442	281447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010278	TG	3	6	281461	281466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_010278	TTG	2	6	281472	281477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010278	A	6	6	281491	281496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010278	TAA	2	6	281517	281522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_010278	TTGAA	2	10	281621	281630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1071	NC_010278	GCTT	2	8	281705	281712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_010278	CGA	2	6	281720	281725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_010278	CGA	2	6	281901	281906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010278	GCA	2	6	281975	281980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010278	G	6	6	282000	282005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010278	TGAA	2	8	282029	282036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010278	AGA	2	6	282117	282122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_010278	CAG	2	6	282143	282148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1080	NC_010278	GGA	2	6	282334	282339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_010278	CGAAGG	2	12	282344	282355	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1082	NC_010278	GAA	2	6	282595	282600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010278	TGC	2	6	282671	282676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_010278	GGA	2	6	282796	282801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010278	TCA	2	6	282821	282826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1089	NC_010278	AC	3	6	283016	283021	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1091	NC_010278	CCT	2	6	283157	283162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1092	NC_010278	CA	3	6	283191	283196	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_010278	AGAA	2	8	283208	283215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_010278	GGT	2	6	283296	283301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_010278	TGT	2	6	283463	283468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010278	A	6	6	283483	283488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010278	GA	3	6	283509	283514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010278	GAAA	2	8	283520	283527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_010278	AGT	2	6	283533	283538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1105	NC_010278	GAA	2	6	283713	283718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010278	AAG	2	6	283756	283761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010278	GAA	2	6	283802	283807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010278	CTA	2	6	283809	283814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_010278	TTA	2	6	283815	283820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_010278	TAA	2	6	283836	283841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_010278	GCG	2	6	283910	283915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_010278	ATT	2	6	284012	284017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_010278	G	6	6	284073	284078	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010278	TCC	2	6	284083	284088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_010278	GTAC	2	8	284187	284194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_010278	GGA	2	6	284393	284398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_010278	AC	3	6	284610	284615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_010278	CGTC	2	8	284628	284635	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_010278	AAC	2	6	284647	284652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1122	NC_010278	CAT	2	6	284743	284748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_010278	AAAG	2	8	284751	284758	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_010278	AGTCG	2	10	284773	284782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1126	NC_010278	AGGTT	2	10	285100	285109	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_010278	GGTG	2	8	285142	285149	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_010278	TGA	2	6	285188	285193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1130	NC_010278	GA	3	6	285317	285322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_010278	GCTG	2	8	285430	285437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_010278	TTA	2	6	285445	285450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_010278	TGCC	2	8	285497	285504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1135	NC_010278	ATG	2	6	285645	285650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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